Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rnf17Q99MV7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Rnf17Q99MV7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Rnf17Q99MV7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rnf17Q99MV7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms