Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gps1Q99LD4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gps1Q99LD4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gps1Q99LD4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms