Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cts3Q91ZD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cts3Q91ZD5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms