Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rassf9Q8K342 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf9Q8K342 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms