Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nek11Q8C0Q4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek11Q8C0Q4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek11Q8C0Q4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek11Q8C0Q4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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