Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdcl3Q8BVF2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcl3Q8BVF2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms