Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Frmd3Q8BHD4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Frmd3Q8BHD4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms