Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ddx11Q6AXC6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ddx11Q6AXC6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx11Q6AXC6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx11Q6AXC6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ddx11Q6AXC6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms