Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou4f3Q63955 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pou4f3Q63955 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms