Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Zic3Q62521 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zic3Q62521 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms