Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhocQ62159 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhocQ62159 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RhocQ62159 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RhocQ62159 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms