Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxd1Q61345 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxd1Q61345 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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