Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctf1Q60753 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctf1Q60753 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms