Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc27a1Q60714 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc27a1Q60714 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a1Q60714 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms