Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms