Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Uspl1Q3ULM6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Uspl1Q3ULM6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Uspl1Q3ULM6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uspl1Q3ULM6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uspl1Q3ULM6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms