Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm5113Q3UGK8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5113Q3UGK8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.9 ms