Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ulk3Q3U3Q1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ulk3Q3U3Q1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms