Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rufy4Q3TYX8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rufy4Q3TYX8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rufy4Q3TYX8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms