Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Srsf6Q3TWW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Srsf6Q3TWW8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms