Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pax5Q02650 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pax5Q02650 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms