Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmc4P54775 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmc4P54775 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms