Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fgd1P52734 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fgd1P52734 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fgd1P52734 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms