Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox2P48432 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox2P48432 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox2P48432 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms