Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bmi1P25916 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bmi1P25916 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bmi1P25916 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms