Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna3P16390 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcna3P16390 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms