Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcrg-V1P06325 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tcrg-V1P06325 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms