Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01793 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01793 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01793 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P01793 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01793 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
P01793 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01793 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01793 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01793 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01793 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01793 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01793 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01793 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms