Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01787 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01787 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01787 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01787 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01787 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01787 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01787 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01787 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01787 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01787 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01787 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01787 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms