Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ier5O89113 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ier5O89113 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ier5O89113 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ier5O89113 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ier5O89113 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ier5O89113 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms