Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BckdkO55028 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BckdkO55028 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdkO55028 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms