Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-ObO35424 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-ObO35424 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms