Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Colca2F8VPY8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Colca2F8VPY8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Colca2F8VPY8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colca2F8VPY8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Colca2F8VPY8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms