Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rfx7F8VPJ6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rfx7F8VPJ6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rfx7F8VPJ6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms