Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Aldh3b2E9Q3E1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms