Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r68E9Q0V3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r68E9Q0V3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms