Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Gm4491E0CX42 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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