Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn7aB1AYL1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn7aB1AYL1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn7aB1AYL1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms