Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nme3Q9WV85 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nme3Q9WV85 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nme3Q9WV85 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 288.7 ms