Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cited4Q9WUL8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cited4Q9WUL8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms