Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tcea2Q9QVN7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tcea2Q9QVN7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tcea2Q9QVN7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms