Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col5a3Q9JLI2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Col5a3Q9JLI2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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