Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OtofQ9ESF1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
OtofQ9ESF1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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