Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpbpQ9EQI5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PpbpQ9EQI5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms