Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SgshQ9EQ08 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SgshQ9EQ08 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SgshQ9EQ08 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms