Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Med29Q9DB91 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Med29Q9DB91 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med29Q9DB91 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med29Q9DB91 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med29Q9DB91 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med29Q9DB91 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med29Q9DB91 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med29Q9DB91 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Med29Q9DB91 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms