Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap5s1Q9D742 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap5s1Q9D742 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap5s1Q9D742 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms