Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chordc1Q9D1P4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Chordc1Q9D1P4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms