Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K7

UPF0687 protein C20orf27 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1K7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1K7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1K7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1K7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1K7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1K7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1K7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9D1K7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms