Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ2

Trim11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim11Q99PQ2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trim11Q99PQ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim11Q99PQ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim11Q99PQ2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms